| Hydrométrie | Le canal du Rhône au Rhin [canal dit "déclassé"] à Hirtzfelden | A034030301 | HIRTZFELDEN Haut-RhinINSEE 68140 | 01/11/2026 |
| Hydrométrie | Le canal du Rhône au Rhin [canal dit "déclassé"] à Obersaasheim | A034030401 | OBERSAASHEIM Haut-RhinINSEE 68246 | 01/11/2026 |
| Hydrométrie | Le canal du Rhône au Rhin [Le Doubs] à Branne | U241202001 | BRANNE DoubsINSEE 25087 | 04/11/2026 |
| Hydrométrie | Le canal du Rhône au Rhin [Le Doubs] à Clerval | U241201001 | PAYS DE CLERVAL DoubsINSEE 25156 | 04/11/2026 |
| Qualité | ALLAN A ETUPES 1 | 06454700 | Étupes DoubsINSEE 25228 | — |
| Qualité | ALLAN A SOCHAUX | 06454800 | Exincourt DoubsINSEE 25230 | — |
| Qualité | BIEF DE COLOMBIER A ST-MAURICE-COLOMBIER 2 | 06446313 | Saint-Maurice-Colombier DoubsINSEE 25524 | — |
| Qualité | CANAL DU RHONE AU RHIN A BOUROGNE | 06455470 | Bourogne Territoire de BelfortINSEE 90017 | — |
| Qualité | CANAL DU RHONE AU RHIN A CHOISEY | 06031000 | Choisey JuraINSEE 39150 | — |
| Qualité | CANAL DU RHONE AU RHIN A DOLE | 06446610 | Dole JuraINSEE 39198 | — |
| Qualité | DOUBS A BESANCON 2 | 06028950 | Besançon DoubsINSEE 25056 | — |
| Qualité | DOUBS A BESANCON 4 | 06028956 | Besançon DoubsINSEE 25056 | — |
| Qualité | DOUBS A BESANCON 5 | 06028957 | Beure DoubsINSEE 25058 | — |
| Qualité | DOUBS A BOUSSIERES | 06029200 | Torpes DoubsINSEE 25564 | — |
| Qualité | DOUBS A CHALEZE 2 | 06028005 | Chalezeule DoubsINSEE 25112 | — |
| Qualité | DOUBS A CLERVAL | 06027300 | Pays-de-Clerval DoubsINSEE 25156 | — |
| Qualité | DOUBS A HYEVRE-PAROISSE | 06018185 | Hyèvre-Paroisse DoubsINSEE 25313 | — |
| Qualité | DOUBS A ST-VIT | 06017104 | Saint-Vit DoubsINSEE 25527 | 27/08/2026 |
| Qualité | DOUBS A VAIRE-ARCIER | 06027700 | Vaire DoubsINSEE 25575 | — |
| Qualité | VEZE A ROCHEFORT-SUR-NENON 2 | 06446700 | Rochefort-sur-Nenon JuraINSEE 39462 | — |
| Poissons | DOUBS A HYEVRE-PAROISSE | 06018185 | HYEVRE-MAGNY DoubsINSEE 25312 | — |
| Poissons | DOUBS A VAIRE-ARCIER | 06027700 | VAIRE DoubsINSEE 25575 | 23/10/2026 |
| Hydrobiologie | 06018185 | 06018185 | Hyèvre-Paroisse DoubsINSEE 25313 | 28/10/2026 |
| Hydrobiologie | 06027700 | 06027700 | Vaire DoubsINSEE 25575 | 04/10/2026 |
| Hydrobiologie | 06446313 | 06446313 | Saint-Maurice-Colombier DoubsINSEE 25524 | 04/10/2026 |
| Hydrobiologie | 06446700 | 06446700 | Rochefort-sur-Nenon JuraINSEE 39462 | 07/10/2026 |
| Hydrobiologie | 06454800 | 06454800 | Exincourt DoubsINSEE 25230 | 04/10/2026 |
| Hydrobiologie | 06455470 | 06455470 | Bourogne Territoire de BelfortINSEE 90017 | 12/10/2026 |